佛伦罗萨vs都灵:醫學轉錄組測序

產品介紹

都灵vs拉齐奥直播 www.myfyrv.com.cn 轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有mRNA。轉錄組測序能夠從整體水平研究基因表達量以及基因結構,揭示特定生物學過程中的分子機理。目前已廣泛應用于基礎研究、臨床診斷、藥物研發等領域。

全面解析mRNA信息

同時獲得樣本的轉錄本結構和轉錄豐度信息

探究疾病相關基因結構變異

挖掘差異表達基因分析致病機制

專業項目方案設計 深度解析數據

從選材到后續研究內容相關信息的挖掘,整個流程嚴謹進行,全程跟蹤。

  • 實驗設計

  • RNA提取

  • 建庫測序

  • 數據分析

  • 售后答疑

樣本要求

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百邁客云,個性化分析全面升級!

可視化操作、交互性基因深度挖掘,關注哪里“”哪里。

【基本操作】基因功能、基因名稱、序列和ID的檢索、關鍵基因功能及通路分析、WGCNA分析等基因功能挖掘。

【個性化挖掘】個性化差異分析方案,個性化圖表優化、共表達趨勢分析、基因結構分析。

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個性化分析8小時云交付,項目進展透明化,盡享極致體驗!

實時追蹤項目進展,一切動向盡在掌握。

意見直接反饋項目經理,高效解決。

可對在線項目各維度的服務進行評價。

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項目經驗豐富,碩果累累

公司成立八年以來,擁有豐富的醫學項目分析經驗,累計完成5千多個樣品的醫學轉錄調控研究

醫學物種涉及人、鼠,樣本類型包括常見組織或細胞,以及體液、毛囊等特殊樣本

公司擁有 40 余項專利技術和 150 余項軟件著作權,根據項目需要選擇方案,保障結果精準

50+項目分析人員

深度數據挖掘

豐富的項目分析案例

優化的交互式報告

8年+項目分析經驗

專業而熱情的售后服務

三個分布式集群服務器

閃電般的分析速度

成功案例

結果展示

數據質控

測序錯誤率受測序儀本身、測序試劑、樣品等多個因素共同影響。由于測序過程中化學試劑的消耗,測序錯誤率會隨著測序序列(Sequenced Reads)長度的增加而升高。此特征是Illumina高通量測序平臺所具有的。

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參考序列比對

與參考基因組進行序列比對,獲取在參考基因組或基因上的位置信息,以及測序樣品特有的序列特征信息。

基因表達水平分析

從箱線圖中不僅可以查看單個樣品基因表達水平分布的離散程度,還可以直觀的比較不同樣品的整體基因表達水平。

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差異表達分析

通過火山圖(Volcano Plot)可以快速地查看基因在兩個(組)樣品中表達水平的差異,以及差異的統計學顯著性。

基因融合分析

所謂融合基因,是指將兩個或多個基因的編碼區首尾相連,置于同一套調控序列(包括啟動子、增強子、核糖體結合序列、終止子等)控制之下,構成的嵌合基因。融合基因可能會導致具有新的或不同功能的基因產物生成,這些異?;钚緣牡鞍字駛岱⒒影┗虻淖饔?。

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差異基因GO分析

GO數據庫是一個結構化的標準生物學注釋系統,建立了基因及其產物功能的標準詞匯體系,其信息適用于各物種。該數據庫結構分為多個層級,層級越低,節點所代表的功能越具體。

案例文章

轉錄組測序數據量選取多大合適?

對于人、鼠等有參考基因組的轉錄組測序,為保證數據分析結果的可靠性和準確性百邁客推薦最低數據量6Gb clean data。如果想挖掘更多轉錄本信息,比如低豐度表達的轉錄本,建議增加數據量。因此,針對不同的研究目的可以靈活的選取相應的數據量。

RNA樣本如何寄送?

對于提取好的RNA樣本可以保存于RNase-free H2O中,然后干冰運輸,對于新鮮組織樣本,取完立即液氮速凍,或保存于?;ひ褐?,然后保存在-80度冰箱。特殊樣本的提取注意事項歡迎咨詢。

如何進行數據挖掘?

可從所有基因,差異基因及SNP三個方面進行數據挖掘。所有基因可通過功能注釋信息,基因ID,基因名稱,序列信息幾個方面進行挖掘,同時還可以做表達基因集維恩圖,WGCNA等分析。差異基因則可通過維恩圖分析不同處理批次幾個差異組合共同的差異基因;通常表達量變化趨勢一致的基因,可能會有相似的功能,故可通過基因共表達趨勢分析來進行差異基因的深入挖掘。SNP則可通過PCA分析,系統進化樹,樣品間差異SNP篩選及目標區域SNP查詢等進行挖掘。以上這些分析均可在我公司云平臺免費完成。